二、Numpy基础

1. np数组的构造

最一般的方法是通过 array 来构造:

In [29]: import numpy as np
In [30]: np.array([1,2,3])
Out[30]: array([1, 2, 3])

下面讨论一些特殊数组的生成方式:

【a】等差序列: np.linspace, np.arange

In [31]: np.linspace(1,5,11) # 起始、终止(包含)、样本个数
Out[31]: array([1. , 1.4, 1.8, 2.2, 2.6, 3. , 3.4, 3.8, 4.2, 4.6, 5. ])
In [32]: np.arange(1,5,2) # 起始、终止(不包含)、步长
Out[32]: array([1, 3])

【b】特殊矩阵: zeros, eye, full

In [33]: np.zeros((2,3)) # 传入元组表示各维度大小
Out[33]: 
array([[0., 0., 0.],
       [0., 0., 0.]])
In [34]: np.eye(3) # 3*3的单位矩阵
Out[34]: 
array([[1., 0., 0.],
       [0., 1., 0.],
       [0., 0., 1.]])
In [35]: np.eye(3, k=1) # 偏移主对角线1个单位的伪单位矩阵
Out[35]: 
array([[0., 1., 0.],
       [0., 0., 1.],
       [0., 0., 0.]])
In [36]: np.full((2,3), 10) # 元组传入大小,10表示填充数值
Out[36]: 
array([[10, 10, 10],
       [10, 10, 10]])
In [37]: np.full((2,3), [1,2,3]) # 每行填入相同的列表
Out[37]: 
array([[1, 2, 3],
       [1, 2, 3]])

【c】随机矩阵: np.random

最常用的随机生成函数为 rand, randn, randint, choice ,它们分别表示0-1均匀分布的随机数组、标准正态的随机数组、随机整数组和随机列表抽样:

In [38]: np.random.rand(3) # 生成服从0-1均匀分布的三个随机数
Out[38]: array([0.99390903, 0.25854328, 0.13560598])
In [39]: np.random.rand(3, 3) # 注意这里传入的不是元组,每个维度大小分开输入
Out[39]: 
array([[0.62634822, 0.06747959, 0.76049576],
       [0.21826591, 0.71708638, 0.98481069],
       [0.38071365, 0.82645691, 0.25598288]])

对于服从区间 (a) 到 (b) 上的均匀分布可以如下生成:

In [40]: a, b = 5, 15
In [41]: (b - a) * np.random.rand(3) + a
Out[41]: array([ 6.40061821,  6.72343487, 10.49412407])

一般的,可以选择已有的库函数:

In [42]: np.random.uniform(5, 15, 3)
Out[42]: array([11.10830186,  7.35193797,  8.46971257])

randn 生成了 (N\rm{(\mathbf{0}, \mathbf{I})}) 的标准正态分布:

In [43]: np.random.randn(3)
Out[43]: array([ 1.2642241 , -1.04640246,  0.05297258])
In [44]: np.random.randn(2, 2)
Out[44]: 
array([[2.65755302, 0.12266858],
       [0.29899713, 0.40504878]])

对于服从方差为 (\sigma^2) 均值为 (\mu) 的一元正态分布可以如下生成:

In [45]: sigma, mu = 2.5, 3
In [46]: mu + np.random.randn(3) * sigma
Out[46]: array([6.46031228, 0.57297935, 5.2692226 ])

同样的,也可选择从已有函数生成:

In [47]: np.random.normal(3, 2.5, 3)
Out[47]: array([2.72546019, 7.42390272, 3.71079215])

randint 可以指定生成随机整数的最小值最大值(不包含)和维度大小:

In [48]: low, high, size = 5, 15, (2,2) # 生成5到14的随机整数
In [49]: np.random.randint(low, high, size)
Out[49]: 
array([[ 6, 10],
       [11, 11]])

choice 可以从给定的列表中,以一定概率和方式抽取结果,当不指定概率时为均匀采样,默认抽取方式为有放回抽样:

In [50]: my_list = ['a', 'b', 'c', 'd']
In [51]: np.random.choice(my_list, 2, replace=False, p=[0.1, 0.7, 0.1 ,0.1])
Out[51]: array(['b', 'd'], dtype='<U1')
In [52]: np.random.choice(my_list, (3,3))
Out[52]: 
array([['a', 'b', 'b'],
       ['a', 'a', 'b'],
       ['c', 'c', 'b']], dtype='<U1')

当返回的元素个数与原列表相同时,不放回抽样等价于使用 permutation 函数,即打散原列表:

In [53]: np.random.permutation(my_list)
Out[53]: array(['b', 'd', 'a', 'c'], dtype='<U1')

最后,需要提到的是随机种子,它能够固定随机数的输出结果:

In [54]: np.random.seed(0)
In [55]: np.random.rand()
Out[55]: 0.5488135039273248
In [56]: np.random.seed(0)
In [57]: np.random.rand()
Out[57]: 0.5488135039273248

2. np数组的变形与合并

【a】转置: T

In [58]: np.zeros((2,3)).T
Out[58]: 
array([[0., 0.],
       [0., 0.],
       [0., 0.]])

【b】合并操作: r_, c_

对于二维数组而言, r_ 和 c_ 分别表示上下合并和左右合并:

In [59]: np.r_[np.zeros((2,3)),np.zeros((2,3))]
Out[59]: 
array([[0., 0., 0.],
       [0., 0., 0.],
       [0., 0., 0.],
       [0., 0., 0.]])
In [60]: np.c_[np.zeros((2,3)),np.zeros((2,3))]
Out[60]: 
array([[0., 0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0., 0.]])

一维数组和二维数组进行合并时,应当把其视作列向量,在长度匹配的情况下只能够使用左右合并的 c_ 操作:

In [61]: try:
   ....:     np.r_[np.array([0,0]),np.zeros((2,1))]
   ....: except Exception as e:
   ....:     Err_Msg = e
   ....: 
In [62]: Err_Msg
Out[62]: ValueError('all the input arrays must have same number of dimensions, but the array at index 0 has 1 dimension(s) and the array at index 1 has 2 dimension(s)')
In [63]: np.r_[np.array([0,0]),np.zeros(2)]
Out[63]: array([0., 0., 0., 0.])
In [64]: np.c_[np.array([0,0]),np.zeros((2,3))]
Out[64]: 
array([[0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0.]])

【c】维度变换: reshape

reshape 能够帮助用户把原数组按照新的维度重新排列。在使用时有两种模式,分别为 C 模式和 F 模式,分别以逐行和逐列的顺序进行填充读取。

In [65]: target = np.arange(8).reshape(2,4)
In [66]: target
Out[66]: 
array([[0, 1, 2, 3],
       [4, 5, 6, 7]])
In [67]: target.reshape((4,2), order='C') # 按照行读取和填充
Out[67]: 
array([[0, 1],
       [2, 3],
       [4, 5],
       [6, 7]])
In [68]: target.reshape((4,2), order='F') # 按照列读取和填充
Out[68]: 
array([[0, 2],
       [4, 6],
       [1, 3],
       [5, 7]])

特别地,由于被调用数组的大小是确定的, reshape 允许有一个维度存在空缺,此时只需填充-1即可:

In [69]: target.reshape((4,-1))
Out[69]: 
array([[0, 1],
       [2, 3],
       [4, 5],
       [6, 7]])

下面将 n*1 大小的数组转为1维数组的操作是经常使用的:

In [70]: target = np.ones((3,1))
In [71]: target
Out[71]: 
array([[1.],
       [1.],
       [1.]])
In [72]: target.reshape(-1)
Out[72]: array([1., 1., 1.])

3. np数组的切片与索引

数组的切片模式支持使用 slice 类型的 start:end:step 切片,还可以直接传入列表指定某个维度的索引进行切片:

In [73]: target = np.arange(9).reshape(3,3)
In [74]: target
Out[74]: 
array([[0, 1, 2],
       [3, 4, 5],
       [6, 7, 8]])
In [75]: target[:-1, [0,2]]
Out[75]: 
array([[0, 2],
       [3, 5]])

此外,还可以利用 np.ix_ 在对应的维度上使用布尔索引,但此时不能使用 slice 切片:

In [76]: target[np.ix_([True, False, True], [True, False, True])]
Out[76]: 
array([[0, 2],
       [6, 8]])
In [77]: target[np.ix_([1,2], [True, False, True])]
Out[77]: 
array([[3, 5],
       [6, 8]])

当数组维度为1维时,可以直接进行布尔索引,而无需 np.ix_

In [78]: new = target.reshape(-1)
In [79]: new[new%2==0]
Out[79]: array([0, 2, 4, 6, 8])

4. 常用函数

为了简单起见,这里假设下述函数输入的数组都是一维的。

【a】 where

where 是一种条件函数,可以指定满足条件与不满足条件位置对应的填充值:

In [80]: a = np.array([-1,1,-1,0])
In [81]: np.where(a>0, a, 5) # 对应位置为True时填充a对应元素,否则填充5
Out[81]: array([5, 1, 5, 5])

【b】 nonzero, argmax, argmin

这三个函数返回的都是索引, nonzero 返回非零数的索引, argmax, argmin 分别返回最大和最小数的索引:

In [82]: a = np.array([-2,-5,0,1,3,-1])
In [83]: np.nonzero(a)
Out[83]: (array([0, 1, 3, 4, 5], dtype=int64),)
In [84]: a.argmax()
Out[84]: 4
In [85]: a.argmin()
Out[85]: 1

【c】 any, all

any 指当序列至少 存在一个 True 或非零元素时返回 True ,否则返回 False

all 指当序列元素 全为 True 或非零元素时返回 True ,否则返回 False

In [86]: a = np.array([0,1])
In [87]: a.any()
Out[87]: True
In [88]: a.all()
Out[88]: False

【d】 cumprod, cumsum, diff

cumprod, cumsum 分别表示累乘和累加函数,返回同长度的数组, diff 表示和前一个元素做差,由于第一个元素为缺失值,因此在默认参数情况下,返回长度是原数组减1

In [89]: a = np.array([1,2,3])
In [90]: a.cumprod()
Out[90]: array([1, 2, 6], dtype=int32)
In [91]: a.cumsum()
Out[91]: array([1, 3, 6], dtype=int32)
In [92]: np.diff(a)
Out[92]: array([1, 1])

【e】 统计函数

常用的统计函数包括 max, min, mean, median, std, var, sum, quantile ,其中分位数计算是全局方法,因此不能通过 array.quantile 的方法调用:

In [93]: target = np.arange(5)
In [94]: target
Out[94]: array([0, 1, 2, 3, 4])
In [95]: target.max()
Out[95]: 4
In [96]: np.quantile(target, 0.5) # 0.5分位数
Out[96]: 2.0

但是对于含有缺失值的数组,它们返回的结果也是缺失值,如果需要略过缺失值,必须使用 nan* 类型的函数,上述的几个统计函数都有对应的 nan* 函数。

In [97]: target = np.array([1, 2, np.nan])
In [98]: target
Out[98]: array([ 1.,  2., nan])
In [99]: target.max()
Out[99]: nan
In [100]: np.nanmax(target)
Out[100]: 2.0
In [101]: np.nanquantile(target, 0.5)
Out[101]: 1.5

对于协方差和相关系数分别可以利用 cov, corrcoef 如下计算:

In [102]: target1 = np.array([1,3,5,9])
In [103]: target2 = np.array([1,5,3,-9])
In [104]: np.cov(target1, target2)
Out[104]: 
array([[ 11.66666667, -16.66666667],
       [-16.66666667,  38.66666667]])
In [105]: np.corrcoef(target1, target2)
Out[105]: 
array([[ 1.        , -0.78470603],
       [-0.78470603,  1.        ]])

最后,需要说明二维 Numpy 数组中统计函数的 axis 参数,它能够进行某一个维度下的统计特征计算,当 axis=0 时结果为列的统计指标,当 axis=1 时结果为行的统计指标:

In [106]: target = np.arange(1,10).reshape(3,-1)
In [107]: target
Out[107]: 
array([[1, 2, 3],
       [4, 5, 6],
       [7, 8, 9]])
In [108]: target.sum(0)
Out[108]: array([12, 15, 18])
In [109]: target.sum(1)
Out[109]: array([ 6, 15, 24])

5. 广播机制

广播机制用于处理两个不同维度数组之间的操作,这里只讨论不超过两维的数组广播机制。

【a】标量和数组的操作

当一个标量和数组进行运算时,标量会自动把大小扩充为数组大小,之后进行逐元素操作:

In [110]: res = 3 * np.ones((2,2)) + 1
In [111]: res
Out[111]: 
array([[4., 4.],
       [4., 4.]])
In [112]: res = 1 / res
In [113]: res
Out[113]: 
array([[0.25, 0.25],
       [0.25, 0.25]])

【b】二维数组之间的操作

当两个数组维度完全一致时,使用对应元素的操作,否则会报错,除非其中的某个数组的维度是 (m\times 1) 或者 (1\times n) ,那么会扩充其具有 (1) 的维度为另一个数组对应维度的大小。例如, (1\times 2) 数组和 (3\times 2) 数组做逐元素运算时会把第一个数组扩充为 (3\times 2) ,扩充时的对应数值进行赋值。但是,需要注意的是,如果第一个数组的维度是 (1\times 3) ,那么由于在第二维上的大小不匹配且不为 (1) ,此时报错。

In [114]: res = np.ones((3,2))
In [115]: res
Out[115]: 
array([[1., 1.],
       [1., 1.],
       [1., 1.]])
In [116]: res * np.array([[2,3]]) # 第二个数组扩充第一维度为3
Out[116]: 
array([[2., 3.],
       [2., 3.],
       [2., 3.]])
In [117]: res * np.array([[2],[3],[4]]) # 第二个数组扩充第二维度为2
Out[117]: 
array([[2., 2.],
       [3., 3.],
       [4., 4.]])
In [118]: res * np.array([[2]]) # 等价于两次扩充,第二个数组两个维度分别扩充为3和2
Out[118]: 
array([[2., 2.],
       [2., 2.],
       [2., 2.]])

【c】一维数组与二维数组的操作

当一维数组 (A_k) 与二维数组 (B_{m,n}) 操作时,等价于把一维数组视作 (A_{1,k}) 的二维数组,使用的广播法则与【b】中一致,当 (k!=n)(k, n) 都不是 (1) 时报错。

In [119]: np.ones(3) + np.ones((2,3))
Out[119]: 
array([[2., 2., 2.],
       [2., 2., 2.]])
In [120]: np.ones(3) + np.ones((2,1))
Out[120]: 
array([[2., 2., 2.],
       [2., 2., 2.]])
In [121]: np.ones(1) + np.ones((2,3))
Out[121]: 
array([[2., 2., 2.],
       [2., 2., 2.]])

6. 向量与矩阵的计算

【a】向量内积: dot

[\rm \mathbf{a}\cdot\mathbf{b} = \sum_ia_ib_i]

In [122]: a = np.array([1,2,3])
In [123]: b = np.array([1,3,5])
In [124]: a.dot(b)
Out[124]: 22

【b】向量范数和矩阵范数: np.linalg.norm

在矩阵范数的计算中,最重要的是 ord 参数,可选值如下:

ord norm for matrices norm for vectors
None Frobenius norm 2-norm
‘fro’ Frobenius norm
‘nuc’ nuclear norm
inf max(sum(abs(x), axis=1)) max(abs(x))
-inf min(sum(abs(x), axis=1)) min(abs(x))
0 sum(x != 0)
1 max(sum(abs(x), axis=0)) as below
-1 min(sum(abs(x), axis=0)) as below
2 2-norm (largest sing. value) as below
-2 smallest singular value as below
other sum(abs(x)ord)(1./ord)
In [125]: matrix_target =  np.arange(4).reshape(-1,2)
In [126]: matrix_target
Out[126]: 
array([[0, 1],
       [2, 3]])
In [127]: np.linalg.norm(matrix_target, 'fro')
Out[127]: 3.7416573867739413
In [128]: np.linalg.norm(matrix_target, np.inf)
Out[128]: 5.0
In [129]: np.linalg.norm(matrix_target, 2)
Out[129]: 3.702459173643833
In [130]: vector_target =  np.arange(4)
In [131]: vector_target
Out[131]: array([0, 1, 2, 3])
In [132]: np.linalg.norm(vector_target, np.inf)
Out[132]: 3.0
In [133]: np.linalg.norm(vector_target, 2)
Out[133]: 3.7416573867739413
In [134]: np.linalg.norm(vector_target, 3)
Out[134]: 3.3019272488946263

【c】矩阵乘法: @

[\rm [\mathbf{A}{m\times p}\mathbf{B}{p\times n}]{ij} = \sum{k=1}^p\mathbf{A}{ik}\mathbf{B}{kj}]

In [135]: a = np.arange(4).reshape(-1,2)
In [136]: a
Out[136]: 
array([[0, 1],
       [2, 3]])
In [137]: b = np.arange(-4,0).reshape(-1,2)
In [138]: b
Out[138]: 
array([[-4, -3],
       [-2, -1]])
In [139]: a@b
Out[139]: 
array([[ -2,  -1],
       [-14,  -9]])